domingo, 18 de diciembre de 2022

Artículo de PCR en Gastritis



Tema: Perfil  transcripcional  de  los  genes  de  virulencia  de  Helicobacter  pylori  en Pacientes  con  Gastritis  y  Cáncer  Gástrico

Objetivo: Diagnostico confirmatorio de infección por H. pylori en pacientes con gastritis y cáncer gástrico, detectando el perfil transcripcional de genes de virulencia.

Muestra biológica: biopsias antrales gástricas

Tipo de Acido Nucleico: ADNc obtenido mediante el protocolo del Kit de reactivos PrimeScriptTM RTa a partir del ARNr.

Extracción de Acido Nucleico: Extracción del ARN total de las muestras y se sintetizó su ADNc con el kit TaKaRa.

Gen/es: cagA , cagA -EPIYAC , cagE y cagY 

Tipo PCR: PCR de ciclos térmicos

 

Desnaturalización inicial

94°C

5 min

Desnaturalización

94°C

30seg

Hibridación

Temperatura de cebadores entre 45°-57°C

45seg

Extensión

72°C

45seg

Extensión final

72°C

5min

#ciclos: 30-35ciclos

Visualización: EFO en gel de agarosa al 1,5 %

Bibliografía: 

1. Hedayati MA, Salavati S. Transcriptional Profile of Helicobacter pylori Virulence Genes in Patients with Gastritis and Gastric Cancer. Dell Agli M, editor. Canadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology [Internet]. 2021 Feb 10 [cited 2022 Dec 17];2021:1–9. Available from: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33628350/

domingo, 11 de diciembre de 2022

Alteraciones de la traducción en Colelitiasis

Figura 1. Expresión fenotípica de mutaciones de MDR3

En el proceso normal de transportes específicos, en general es necesaria la acción de MDR3, la proteína canalicular involucrada en el transporte de fosfatidilcolina (PC) a la bilis, lo cual se ha visto alterado al presentar una mutación heterocigota del gen MDR3, en el exón 14 codón 535, que da como resultado la sustitución de glicina por ácido aspártico. Esta modificación conlleva a la producción de una bilis con bajo contenido en  PC, mayor litogenicidad y alto poder detergente, siendo asociadas con diferentes enfermedades como la colelitiasis (1).
Bibliografía 
1. Lucena J-F, Herrero JIgnacio, Quiroga J, Sangro B, Garcia-Foncillas J, Zabalegui N, et al. A multidrug resistance 3 gene mutation causing cholelithiasis, cholestasis of pregnancy, and adulthood biliary cirrhosis. Gastroenterology [Internet]. 2003 Apr [cited 2022 Nov 11];124(4):1037–42. Available from: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0016508503000581

‌2. Poupon R. Hiperbilirrubinemias y colestasis genéticas. EMC - Tratado de Medicina [Internet]. 2011 Jan [cited 2022 Nov 11];15(1):1–4. Available from: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1636541011709655

domingo, 4 de diciembre de 2022

Alteraciones de la Transcripción en Gastritis por Helicobacter pylori



 La respuesta inflamatoria hacia Helicobacter pylori se relaciona con factores genéticos, en donde encontramos el polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) en TNF-α, la citocina proinflamatoria que participa en la defensa contra la infección por H. pylori, la cual en altas concentraciones llega a dañar el epitelio gástrico reduciendo la secreción de ácido gástrico. Esas concentraciones generalmente se presentan por el SNP que sustituye una guanina (G) por una adenina (A) en la posición -308, ya que con ello el factor de transcripción AP-1 se une con mayor afinidad a la región promotora de TNF -α, lo cual se ha estudiado en pacientes con gastritis (1).

Bibliografía
1. Heziquio J. Polimorfismo -308G/A de TNF-alfa y genotipos babA2 y cagA de Helicobacter pylori en pacientes con gastritis crónica y úlcera gástrica [Internet]. [Chilpancingo]: Universidad autónoma de guerrero; 2010 [cited 2022 Dec 4]. Available from: http://ri.uagro.mx/bitstream/handle/uagro/253/OK07285947_TM2007.pdf?sequence=1&isAllowed=y
2. Andalas M, Hakimi M, Nurdiati DS, Astuti I, Imran I, Harapan H. Association of −308G/A TNF-α gene polymorphism and spontaneous preterm birth in Acehnese ethnic group, Indonesia: This polymorphism is not associated with preterm birth. Egypt J Med Hum Genet [Internet]. 2016 Jan 1 [cited 2022 Dec 4];17(1):33–40. Available from: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1110863015000488#f0010